選型所面臨的第一個問題是購買商品化軟件還是自行開發。后者的好處不言自明，例如可以根據企業的特點量體裁衣，但是這種方式的風險也是很明顯的，大致可以歸納為以下幾點。
風險一:是否有足夠的專業技術隊伍。
風險二:開發周期長，系統在功能方面不能形成規模，從而充分滿足整個企業管理流程的需要。
風險三:系統維護和擴展難以跟上信息技術發展。
風險四:因缺乏專業化軟件產品開發的經驗，給系統維護帶來困難。
風險五:系統過于依賴少數開發人員，一旦關鍵人員離開并無法替代，將導致整個系統的癱瘓。
風險六:長期投資大，難以收尾。自主開發的先期投資會比購買商品化軟件低，但從長遠來看，由于需要高薪維持一支強大的開發和維護隊伍，其實際投資要比購買現成軟件系統大得多。
風險七:阻礙企業管理變革。由于系統完全根據現狀定制，缺乏足夠的靈活性，一旦企業內部進行深化改革，系統可能無法滿足需要。
但是，如果企業選擇購買商品化軟件，就會遇到選型的問題，同樣會存在風險，具體歸納如下。
風險一:系統功能不能滿足企業管理流程需要。
風險二:軟件系統的規模和可擴展性與企業的現狀和未來的增長及發展戰略產生矛盾。
風險三:軟件供應商缺乏足夠的服務支持，并且一旦其退出市場，用戶會失去系統維護和升級方面的支持。
風險四:軟件系統的規模過大，造成實施難度大、周期長，甚至失敗。
風險五:軟件供應商缺乏自身或合作伙伴的實施支持能力。
風險六:軟件系統過于復雜，用戶員工的計算機應用素質較低，難以實現知識轉移。
風險七:系統的技術支持和復雜程度使用戶難于發現和保留專門人才對系統進行后續支持和開發。
風險八:一次性投入過于龐大，企業難以承受。