由于ERP系統涉及到企業資源和計算機，而且涉及到企業財務應收應付流程、發貨與收貨流程、客戶訂單接受與生產單發放流程、盤點流程、領料與出庫流程中企業的深層業務活動，因此對ERP實施的過程中要對計算機軟件的實施過程以及實施過程中的管理進行雙層的監控。這要求企業既要對軟件實施本身的生命周期的需求、計劃進行實現，同時還要對實施本身的管理變革進行監控，以典型的流程和單據來驅動項目的開展。我國企業由于對ERP本身的陌生、對ERP實施過程的管理模式的變遷缺乏經驗，因此很難對實施質量進行把關。通過近三年對30余家MRPII/ERP應用企業、十多家中外ERP軟件公司的實地調查研究，發現當今我國企業實施ERP系統存在以下幾個問題：

這主要有下面幾個原因：

1、外來詞匯多設置了較高的ERP心理門檻。

由于ERP系統是一個綜合性的系統，從ERP供應商、ERP咨詢公司、企業ERP宣傳、政府對ERP的推動、研究單位對ERP的介紹都是從不同的角度來看待ERP系統及其實施，而且涉及到經濟利益和商業機密，因此較難全面地提供ERP實施的詳細資料，而且深入淺出介紹ERP系統及其實施的書和文章也很少，因此使得整個ERP實施方法的研究有難度。此外，圍繞ERP系統集合了BRP、JIT、CIMS、虛擬企業、協同商務等龐大的新名詞和外文詞匯，為廣大的企業管理人員設立了心理門檻，心理恐懼使得眾多的管理人員把ERP看得很神秘，因此對于ERP實施過程的把握顯得非常難。

2、國外ERP軟件商有非常規范的ERP實施方法,但是難以完全貼近我國企業的實際需求和定制過程。

國外ERP軟件公司如SAP、ORACLE、IFS、QAD、SYMIX等的ERP實施方法非常細致，每個階段和過程都有具體的文檔和可交付的成果，而且步驟嚴密、實施周期長，但是在實際執行過程中由于企業發展快、實施顧問水平有高有低、企業管理水平的低落和人員素質不高、實施經費不足、培訓不力等眾多因素使得項目執行中不能按照規定的ERP實施方法做，高昂的實施成本使得某些ERP項目避重就輕，項目的徹底實施落空。因此，由于我國企業的生產計劃模式的復雜以及市場的不確定性大，多數企業的ERP應用主要是財務管理和管理會計的功能用得最好，因此在實施過程中一期工程主要是在財務總帳、應收應付、管理會計、物料管理等核心模塊的實施上，后續的二期工程難以開展。企業在ERP實施過程中涉及到的業務流程重組也主要是圍繞上述幾個會計和物料模塊展開，全面的流程重組還難以實現。

3、國內眾多ERP企業管理軟件商有豐富的ERP實施經驗,但無科學規范的實施方法，反映出ERP軟件公司內部管理的薄弱和對ERP實施中的管理問題不重視。