1999年6月，“北京市工商行政管理局財務管理信息系統”開始實施。實施過程具體劃分為以下5個階段，即制定計劃、試點運行、用戶培訓、正式運行、評審驗收。實施工作中強調在各步驟建立規范和詳盡的實施文檔，從而更準確地反映用戶需求、更高效地完成階段任務、更穩健地達到實施目標。

第一階段：明確目標和制定實施計劃

雙方討論軟件實施過程潛在的各種風險，并對風險性高低做出評價，最終制定出實施計劃和進度，盡可能避免出現風險。

第二階段：試點運行

為了保證系統的運行成功，雙方決定選取西城和宣武兩區的工商局進行試點運行。通過試運行期間的磨合，用戶熟悉了軟件功能，并且在實際業務中的問題也得以及時解決。

第三階段：用戶培訓

7月初，實施小組制定了全面的用戶培訓計劃，組織北京市工商行政管理局下屬19家分局財務人員集中進行了培訓，包括軟件中一些先進的管理思想、軟件功能、業務流程等；對總局系統管理員進行了數據庫維護、網絡安全等技術培訓。

第四階段：正式運行

8月開始在全系統進行推廣，在雙方的共同努力下，9月初，全市19個分局全部通過了試運行并正式投入使用。

第五階段：審查驗收

9月底，北京市工商行政管理局財務管理信息系統驗收成果會在京召開。來自財政部、國家工商行政管理局、北京市各行政主管單位的領導出席了新聞發布會。北京市工商行政管理局王紀平局長和用友軟件集團王文京總裁代表雙方在驗收報告上簽字，此次驗收標志著北京市工商局成功實現網絡財務管理，在“電子政務”方面又邁出了可喜的一步。