流程風險包括營運風險、授權風險、信息技術風險和財務風險，主要體現在以下方面。

項目在實施過程中的負面效應可能會破壞正常的業務流程并影響業務的連續性，從而對設備和工作環境造成影響；另外由于無法獲得既懂管理又懂系統的專門人才，項目的結果可能會不符合管理層和最終用戶的期望。

項目的管理人員缺乏良好的領導能力，管理層過分依賴尚未經過可靠測試的系統所提供的信息，管理人員沒有對話作流程與管理思想的轉變做好準備，公司的供應商也可能不具備系統所要求的多本素質。

信息技術基礎結構存在問題，可能影響報表的完整性、準確性和數據的可獲得性。

在系統實施過程中由于管理層和雇員故意歪曲項目的狀況或通過對未設置完成的計算初后統改變數據而獲取利益。

由于ERP項目一般規模較大，項目資金的支付也可能造成現金的緊張。

決策信息風險

導致決策信息風險的主要因素是在制定預算時往往基于某些假設，可能在實際運作過程中無法操作；用于指導和管理業務的財務信息沒有與非財務信息很好地實現集成，系統所產生的報表可能不符合行政管理的要求；為了減少項目風險避免業務中斷，可能投入過多的資源以致開展正常業務所需的資源短缺。

綜上所述，企業應用ERP系統，存在一定的風險，分析風險的目的不是要企業放棄實施ERP系統，而是要企業充分估計風險，正確對待風險，認識到ERP的實施是管理項目而不僅僅是IT項目，并通過項目管理有針對性地管理風險，從而成功實施ERP。