第三，是基于應用的互補性。根據企業目前的內外部條件，企業在引進電子商務時，不會完全摒棄傳統的采購與銷售模式，而是兩種模式、兩個系統共存，互為補充。
用聯系的觀點去看待整合
電子商務和ERP都是知識經濟浪潮中孕育而生的產物，它們之間存在著不同，卻又相互緊密地聯系在一起。如果說企業信息化建設的第三個階段是建設企業核心的業務管理和應用系統階段，在這個階段最有代表性的是企業內部的ERP——它不是機械地適應企業現有的流程，而是對企業流程中不合理的部分提出改進和優化建議，并可能導致組織機構的重新設計和業務流程重組。那么我們不難得出一個結論：電子商務是建立在ERP基礎之上的應用。也就是說，ERP是企業實施電子商務的支撐系統。
從另一個角度來看，電子商務與ERP可以被歸為同一個層次的應用，只是側重點不同——ERP主要針對企業內部的管理，而電子商務是以與外部交互為主。企業如果在ERP系統不完善的情況下急于開展電子商務，往往會導致很多意想不到的情況發生，而這些事情往往會給企業的形象、信譽帶來很大的損害。例如，現在國內很多交易網站就常出現這種情況，它們在網上接到大量的訂單，卻無法自動對訂單進行處理，最后造成有的訂單丟失，有的貨物沒給顧客送去，甚至有的貨物在網上顯示還有幾件，但到庫房里去查卻發現沒有了。如果企業前端的B2B系統與后臺ERP系統脫節，這些讓消費者不高興的事情便會經常發生。企業要想真正在電子商務上有所作為，其后臺的ERP系統就必須建好。因此，由于電子商務與ERP之間存在著種種密切的聯系，我們不能再把它們簡單地看作是兩個獨立的對象，而是應該用聯系的觀點去認識和研究它們。
企業要想在ERP系統上完美應用電子商務并不是一件容易的事情。國外電子商務的飛速發展，是在完成工業化，進入信息化，計算機的應用已經相當普及，信用卡的應用已達到相當高的水平，在信譽驗證、結算與支付、配送與物流系統、安全保密措施以及法律法令等方面有了可靠保障的情況下實現的。開展B2B應用的企業如果沒有一套ERP系統是不可能具備迅速及可靠響應的。ERP就像企業練的內功，沒有這點內功，就很難在市場上沖殺。
一般說來，企業的信息化首先要完成的是企業范圍內信息的溝通，建立與各分公司、分廠、辦事處、銷售網點、地區倉庫聯系的企業內部網(Intranet)以及辦公自動化系統(OA)，建立企業的Web網頁和電子郵件系統，與長期合作伙伴之間建立企業外聯網(Extranet)或電子數據交換系統(EDI)。當ERP和電子商務在初始整合的時候，兩個系統下的采購數據、銷售數據和財務數據如果沒有進行合并，必然會造成數據失去一致性和完整性；而軟件資源、硬件資源和數據資源如果沒有充分共享，會造成建設成本過高和存儲空間浪費。這些都是我們在對電子商務平臺和ERP系統整合時應該重點關注的地方。如果我們將新的整合系統分為七個層次，即網絡層、數據庫層、公共層、總線層、中間件層、表現層和應用層，則電子商務與ERP的整合不僅需要應用層各模塊的重新組合與集成，而且也必須有數據庫層和操作系統層來做支持。一般認為開放式數據庫互連(ODBC)和不同操作系統間的互訪性可以為電子商務與ERP的整合提供這種技術支撐平臺。但僅僅靠目前的這些是遠遠不夠的，留待軟件廠商去解決的問題依然很多，不過電子商務和ERP的整合始終是一種趨勢。

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