電子商務幫助企業改革企業交易流程管理，形成新的企業交易流程管理模式，提高企業管理的效率。電子商務下的企業交易流程管理創新主要體現在以下兩個方面1、改革以往以貿易單據(文件)流轉為主體的企業交易流程和交易方式，實現企業交易流程和交易方式創新。

傳統的企業交易方式是一種建立在紙面貿易單據(文件)的流轉基礎上的貿易方式。在傳統企業交易方式下平均每做成一筆生意需要30份紙面單證。全世界每年因貿易活動而產生的紙面文件數額龐大。在這些大量貿易單據的流通過程中，買方和賣方之間的貿易數據和紙面文件的處理工作(包括文件繕制、郵寄、管理等)往往產生大量的時間延誤，并且每次重復輸入數據都可能產生錯漏等方面的問題。快速發展的企業迫切要求實現全球貿易運作環境的信息化，電子商務的發展正好滿足了這種需要。電子商務是一種以信息網絡為載體的新的商務運作模式。在電子商務中，交易各方以電子方式而不是通過直接面談方式或當面交換方式來達成或進行國際商品或服務的交易。電子商務采用數字化電子方式進行商務數據交換和開展商務活動實現了對以紙面貿易單據(文件)流轉為主體的傳統企業交易流程和交易方式的改革。在傳統企業交易方式下企業交易流程需要19個環節，而在電子商務方式下只需要7個環節。

2．實現交易流程管理的電子化、信息化、自動化、實時化和規模化電子商務的核心內容是信息的互相溝通和交流。企業商品交易的前期是交易雙方通過因特網進行交流，洽談確認，后期是電子付款和貨物運輸及踢蹤。這些交易過程都可以依托電子商務實現外貿業務全過程管理的電子化。在我國對外貿易領域中，外貿運輸的電子化管理率先發展起來。它是通過中國國際電子商務網在全國所有口岸建立起對外貿易運輸的企業內部網。貨物運輸的訂艙、單證傳輸、集裝箱管理、船舶管理、貨物跟蹤、財務及結算運作過程將實施國際標準的電子商務單證傳遞，采用網上貨物跟蹤系統，使客戶和貿易伙伴直接進行查詢以獲得有關貨物狀態的信息，也可通過中國國際電子商務網了解運輸方面的商業伙伴的數據信息，從而減少貨物的庫存天數，降低成本，縮短貨物結關時間，提高企業的經濟效率。